認證成本大幅增加：重新認證（初審）通常比監督審核費用高。企業不僅需要承擔更高的認證費用，還需投入更多時間和人力資源重新準備全套材料，尤其是新規實施后時間沉沒成本更高；

管理層精力分散：重新認證需要全面準備材料，包括重新編寫體系文件、準備大量記錄文件等，會消耗管理層大量精力和時間；

企業信用受：認證證書被暫停、撤銷、注銷可能會被記錄并在相關部門間共享。隨著信用體系建設日益完善，這種不良記錄可能影響企業在其他領域的信用評價。

制定認證預算預留機制：將認證費用納入企業年度固定預算，確保證書維護的資金保障。認證費用應視為維護市場準入資格的必要投資，而非可削減的成本；

建立內部體系運行檢查制度：每月由體系負責人組織一次內部檢查，確保持續符合認證要求。這樣既可保證隨時迎接監督審核，又能真正發揮體系管理對企業管理的提升作用；

與認證機構保持良好溝通：出現經營困難或重大變化時，及時與認證機構溝通，尋求合規解決方案。認證機構可提供針對性建議，幫助企業最大限度降低證書風險；

認真對待年度審核：年度審核不是“走過場”，而是檢驗體系運行有效性的重要機會。企業應充分利用年度審核，發現管理中的不足，持續改進體系運行質量。